Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxb1P17919 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms