Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa-rs1P17533 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs1P17533 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms