Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tph1P17532 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tph1P17532 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms