Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms