Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkceP16054 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms