Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf1P15314 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf1P15314 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms