Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl1P12850 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms