Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a1P12813 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms