Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DmdP11531 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DmdP11531 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DmdP11531 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DmdP11531 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DmdP11531 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DmdP11531 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DmdP11531 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DmdP11531 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DmdP11531 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DmdP11531 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DmdP11531 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DmdP11531 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DmdP11531 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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