Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamp1P11438 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamp1P11438 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms