Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6P10629 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6P10629 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms