Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P10404 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P10404 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P10404 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P10404 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P10404 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P10404 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P10404 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P10404 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P10404 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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