Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CatspereP0DP43 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CatspereP0DP43 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms