Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igsf6P0C6B7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms