Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa1P09022 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa1P09022 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms