Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NefmP08553 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NefmP08553 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NefmP08553 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NefmP08553 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NefmP08553 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NefmP08553 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NefmP08553 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NefmP08553 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NefmP08553 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NefmP08553 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NefmP08553 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NefmP08553 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NefmP08553 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NefmP08553 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NefmP08553 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NefmP08553 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefmP08553 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NefmP08553 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NefmP08553 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NefmP08553 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NefmP08553 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NefmP08553 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NefmP08553 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NefmP08553 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NefmP08553 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NefmP08553 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NefmP08553 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefmP08553 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NefmP08553 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NefmP08553 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NefmP08553 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NefmP08553 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NefmP08553 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NefmP08553 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NefmP08553 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NefmP08553 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NefmP08553 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NefmP08553 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NefmP08553 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NefmP08553 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NefmP08553 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NefmP08553 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NefmP08553 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NefmP08553 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NefmP08553 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NefmP08553 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NefmP08553 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefmP08553 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefmP08553 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefmP08553 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefmP08553 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefmP08553 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms