Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col3a1P08121 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col3a1P08121 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col3a1P08121 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col3a1P08121 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms