Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spta1P08032 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spta1P08032 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms