Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna4P07351 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms