Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TnfP06804 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TnfP06804 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TnfP06804 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TnfP06804 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TnfP06804 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TnfP06804 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TnfP06804 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TnfP06804 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TnfP06804 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TnfP06804 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TnfP06804 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TnfP06804 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TnfP06804 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TnfP06804 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TnfP06804 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TnfP06804 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TnfP06804 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TnfP06804 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TnfP06804 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TnfP06804 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnfP06804 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnfP06804 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TnfP06804 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TnfP06804 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TnfP06804 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnfP06804 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnfP06804 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnfP06804 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TnfP06804 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnfP06804 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnfP06804 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnfP06804 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnfP06804 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnfP06804 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TnfP06804 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TnfP06804 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms