Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06330 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06330 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06330 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06330 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06330 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06330 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P06330 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06330 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06330 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06330 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06330 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P06330 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06330 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P06330 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06330 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06330 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06330 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06330 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms