Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Got1P05201 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Got1P05201 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Got1P05201 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Got1P05201 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Got1P05201 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Got1P05201 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Got1P05201 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Got1P05201 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Got1P05201 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Got1P05201 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Got1P05201 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Got1P05201 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Got1P05201 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Got1P05201 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Got1P05201 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Got1P05201 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Got1P05201 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Got1P05201 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Got1P05201 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Got1P05201 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms