Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P04214 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04214 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P04214 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P04214 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P04214 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04214 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04214 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04214 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04214 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04214 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04214 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04214 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04214 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
P04214 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04214 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P04214 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P04214 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P04214 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P04214 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04214 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04214 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04214 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04214 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04214 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04214 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04214 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04214 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms