Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-K1P01901 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-K1P01901 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms