Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01811 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01811 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01811 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01811 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01811 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01811 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01811 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01811 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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