Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01796 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01796 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01796 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01796 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01796 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01796 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01796 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01796 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01796 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01796 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01796 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01796 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms