Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01790 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01790 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01790 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01790 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01790 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01790 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01790 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01790 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01790 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01790 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01790 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01790 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01790 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01790 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01790 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01790 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01790 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01790 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01790 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01790 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms