Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01788 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01788 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01788 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01788 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01788 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01788 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01788 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01788 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01788 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01788 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01788 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01788 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01788 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01788 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01788 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01788 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms