Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01724 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01724 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01724 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01724 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01724 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01724 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01724 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01724 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01724 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01724 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01724 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01724 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01724 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01724 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms