Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01649 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01649 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01649 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01649 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01649 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01649 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01649 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01649 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01649 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01649 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01649 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01649 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01649 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01649 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01649 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01649 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01649 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms