Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp8O89110 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms