Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl20O89093 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms