Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gnpda1O88958 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gnpda1O88958 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gnpda1O88958 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gnpda1O88958 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms