Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
F11rO88792 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
F11rO88792 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
F11rO88792 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
F11rO88792 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
F11rO88792 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
F11rO88792 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
F11rO88792 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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