Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp23O88676 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp23O88676 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp23O88676 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp23O88676 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp23O88676 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp23O88676 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp23O88676 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp23O88676 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp23O88676 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp23O88676 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp23O88676 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp23O88676 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp23O88676 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms