Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacng2O88602 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng2O88602 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng2O88602 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms