Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops6O88545 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cops6O88545 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops6O88545 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cops6O88545 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms