Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AvilO88398 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AvilO88398 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AvilO88398 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AvilO88398 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AvilO88398 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AvilO88398 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AvilO88398 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AvilO88398 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AvilO88398 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AvilO88398 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AvilO88398 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AvilO88398 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AvilO88398 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AvilO88398 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AvilO88398 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AvilO88398 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AvilO88398 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AvilO88398 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AvilO88398 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AvilO88398 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AvilO88398 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AvilO88398 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms