Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc4a4O88343 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a4O88343 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a4O88343 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms