Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfdp1O88271 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms