Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk1O70551 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms