Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx7O70439 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx7O70439 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx7O70439 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms