Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb5O70309 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms