Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9aO70228 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9aO70228 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms