Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms