Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb5O55234 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb5O55234 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb5O55234 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psmb5O55234 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms