Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap2O55126 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms