Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap1O55125 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms