Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SncaO55042 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SncaO55042 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SncaO55042 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SncaO55042 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SncaO55042 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SncaO55042 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SncaO55042 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SncaO55042 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncaO55042 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaO55042 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaO55042 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaO55042 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms