Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bnip3O55003 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnip3O55003 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms